API Reference

• combine_states module
• cutpoints module
• deepest_ti module
• expm module
• get_emission_prob_mat module
• get_joint_prob_mat module
• get_tab module
• get_trans_emiss module
• helper_omegas module
• int_combine_states module
• int_get_emission_prob_mat module
• int_get_joint_prob_mat module
• int_get_ordered module
• int_get_tab module
• int_get_times module
• int_get_trans_emiss module
• int_load_trans_mat module
• int_optimizer module
• int_shared_data module
• int_vanloan module
• ncpu module
• optimizer module
• read_data module
• run_markov_chain_AB module
• run_markov_chain_ABC module
• trans_mat module
• vanloan module
• workflow_int_optimize module
• workflow_int_posterior module
• workflow_int_viterbi module
• workflow_optimize module
• workflow_posterior module
• workflow_viterbi module
• yaml_helpers module